Το Grand Theft Auto 3D είναι ένα mod για το GTA III που στοχεύει να αναδημιουργήσει πώς ήταν το παιχνίδι πριν από την κυκλοφορία του. Χρησιμοποιώντας πρώιμα στιγμιότυπα οθόνης, Alpha Mines και gameplay πριν από την κυκλοφορία, η ομάδα ή οι modders πέρασαν πάνω από τέσσερα χρόνια δημιουργώντας αυτήν την πρώιμη έκδοση του GTA III. Μετά από αυτόν τον μακρύ κύκλο ανάπτυξης, το mod κυκλοφόρησε τελικά στις αρχές Ιανουαρίου. Το mod λειτουργεί με την έκδοση PC του GTA III. Αυτή η έκδοση του GTA III είχε αρχικά προγραμματιστεί να κυκλοφορήσει σε PS2 και Dreamcast. Η ομάδα modding ήθελε να συμπεριλάβει όσο το δυνατόν περισσότερα από τα στοιχεία πρώιμης ανάπτυξης, ακόμη και να προσθέσει στο αρχικό HUD. Η διάταξη του Liberty City είναι επίσης πολύ διαφορετική. Πολλά κτίρια λείπουν, τα οποία αντικαταστάθηκαν από στενότερες κατασκευές ή γρασίδι. Το γενικό στυλ τέχνης είναι πιο πολύχρωμο και παρόμοιο με παλαιότερους τίτλους απογόνων GTA.
Οι θαυμαστές μπορεί επίσης να παρατηρήσουν ότι τα αυτοκίνητα της αστυνομίας και άλλα οχήματα έκτακτης ανάγκης μοιάζουν πολύ περισσότερο με τα αντίστοιχα της πραγματικής ζωής στη Νέα Υόρκη. Το GTA III έλαβε κάποιες οπτικές αλλαγές μετά τα τραγικά γεγονότα ή την 11η Σεπτεμβρίου. Μια τέτοια αλλαγή ήταν ότι τα αυτοκίνητα της αστυνομίας έγιναν ασπρόμαυρα αντί για τα γαλανόλευκα περιπολικά που βρέθηκαν στη Νέα Υόρκη και φάνηκαν στα πρώτα στιγμιότυπα οθόνης ή στο GTA III. Ο Claude, ο σιωπηλός πρωταγωνιστής ή GTA III, φαίνεται πολύ διαφορετικός. Όπως επεσήμανε ο χρήστης 3li0507 του φόρουμ GTA, η Rockstar είχε πολλές διαφορετικές εμφανίσεις για τον Claude, κάνοντας τον να δείχνει πραγματικά χλωμός. Η ομάδα ή οι modders δεν αλλάζουν απλώς οπτικά το GTA III για αυτήν τη ζαριά, αλλά επεξεργάζονται τον τρόπο με τον οποίο χειρίζονται τα αυτοκίνητα, αλλάζοντας την αίσθηση του παιχνιδιού και ανακατεύοντας με άλλα κομμάτια ή το GTA III. Το τελικό αποτέλεσμα είναι ένα παιχνίδι που μοιάζει σαν να έχει πέσει από ένα εναλλακτικό σύμπαν.
